神经外科开展较早，自1985年就施行开颅手术以来，经过多年的发展，现已能独立顺利开展脑瘤切除术、硬脑膜翻转治疗失状窦破裂修补术及颅脑外伤等复杂手术。近几年已成功抢救几十例重度颅脑外伤病人，并成功开展了窦旁脑肿瘤，窦汇脑肿瘤，镰旁脑肿瘤，幕上、幕下入路脑肿瘤切除术，脑转移瘤切除术，全脑血管造影（DSA）术，脑动脉瘤介入治疗术等，收到了较好的效果，并在地州上获得了相应的奖项

科室坚持“科有特色、人有专长”的发展方向，培养了一支临床经验丰富、技术精湛、专业能力强、乐于奉献的团队，做到术业有专攻，目前年手术量已突破1500余台次。优势技术：头颈肿瘤诊断、手术及功能重建，听力重建技术，功能性鼻内镜技术；科室曾荣获省级科学技术进步三等奖一项，荣获红河州科技进步二等奖四项，三等奖四项，获多项医院新技术、新成果奖。是红河州耳鼻咽喉质控中心挂靠单位，红河州医学会耳鼻咽喉头颈外科主任委员单位。

红河州第三人民医院妇科是一个专业诊治妇女生殖系统疾患的科室。我院妇科（肿瘤妇科）是一个专业诊治妇女生殖系统疾患的科室，诊治的疾病包括：女性生殖器肿瘤（各部位恶性和良性肿瘤）；盆底功能障碍（子宫脱垂，生殖道瘘等）；女性生殖器畸形（子宫纵隔，先天性无阴道等）；其它女性生殖器疾病（剖宫产术后瘢痕妊娠、子宫内膜异位症，不孕症等）；生殖内分泌疾病（功能失调性子宫出血，闭经，痛经等），女性生殖器炎症（各部位炎症及性病），人工智能宫颈癌筛查（TS）。计划生育操作（无痛人流、药物流产、放取节育环、中孕引产）。

我院骨科、疼痛科是州内创伤急救研究中心重点科室之一，是一个集骨外科、疼痛科于一体的综合性科室，是一个集关节、脊柱、创伤、运动医学、骨肿瘤骨病、显微皮瓣修复为一体的综合性骨科。